Delen 1 - 3: Van den mensch en enige zoogende dieren, Delen 4 - 5: De vogelen, Deel 6: Dieren van beyderley leven, Delen 7 en 8: De visschen, Delen 9 t/m 13: De insekten, Deel 14: De wormen en slakken, Deel 15: De schulpdieren, Deel 16: De hoorens, Deel 17: De zee-gewassen, Deel 18: De plantdieren. Hoewel de titel anders doet vermoeden is "Natuurlyke historie, of, uitvoerige beschryving der dieren, planten, en mineraalen" geen Nederlandse vertaling van werken van Carl Linnaeus, de vader van de moderne taxonomie. Houttuyn maakt gebruik van het systeem van Linnaeus om organismen te classificeren en benoemen met behulp van het binominale systeem, waarbij elke soort een geslachtsnaam en een specifieke naam krijgt. Het werk is veel omvangrijker: '(...) Houttuyn's entire "Natuurlyke Historie" consisted of 21,500 pages of text, with 296 copper plates, compared to Linnaeus's 12th edition of the "Systema Naturae" compromising only about 2370 pages, with three plates.' (Boeseman en De Ligny). De gehele set bestaat uit 37 delen. 1-18 dieren, 1-14 planten, 1-5 mineralen. Dit zijn de eerste 18 delen over het dierenrijk en is met ruim 7500 pagina's aanzienlijk groter dan het 823 pagina's tellende deel "Animalia" van Linnaeus' 10e editie. M. Boeseman en W. de Ligny, "Martinus Houttuyn (1720 - 1798) and his contributions to the natural sciences, with emphasis on zoology" (2004) 21.